BDF极简输入指南

<<TableOfContents()>>

= BDF输入文件的结构  =

BDF极简输入有四个功能块组成，如下：
{{{
 #!bdf.sh
 B3lyp/TDDFT/3-21G nroots=10

 geometry 
 O  0.00000   0.00000    0.36937
 H  0.00000  -0.78398   -0.18468 
 H  0.00000   0.78398   -0.18468 
 end geometry 

 $tddft
 memjkop
  128MW
 $end
}}}

== 第一输入块 ==
只有一行，以 “#!” 开始，后面为输入脚本名字，例如 #!ch2.bdf

== 第二输入块 ==
从第二行开始，至geometry行前一行结束。
这一输入块，可能由多行组成，是BDF的命令行控制行，用于指定BDF做什么计算任务，采用什么方法，命令行内容以空格作为间隔分开不同的关键词。


== 第三输入块 ==
本块输入几何结构，从 geometry行起始，到end geometry结束。几何结构可以按照直角坐标，内坐标，或指定xyz文件的形式输入。
注意，geometry域可以指定 
1 简单分子结构输入。
2 通过指定xyz文件定义分子结构
3 简单内坐标模式  
4 内坐标模式，定义势能面扫描 
5 内坐标模式，定义冗余内坐标进行结构优化 5 定义分子片，支持FLMO，Onim等计算模式。

例1: 直角坐标形式输入几何结构
{{{
Geometry
O  0.00000   0.00000    0.36937
H  0.00000 -0.78398   -0.18468 
H  0.00000   0.78398   -0.18468 
End geometry
}}}

例2: 内坐标形式输入
{{{
Geometry
O
H  1   0.9
H. 1   0.9. 2. 109.0
End geometry
}}}

例3: 内坐标形式输入
{{{
Geometry
O
H  1   R1
H. 1   R1.  2  A1

R1 = 0.9
A1 = 109.
End geometry
}}}

例4: 内坐标形式输入,势能面扫描
H2O的坐标输入，势能面扫描，键长从0.75 开始，按照0.05 step，计算20个点。
{{{
Geometry
O
H  1   R1
H. 1   R1  2  109

R1. 0.75 0.05 20
End geometry
}}}

例5: 内坐标形式输入,势能面扫描
H2O的坐标输入，势能面扫描，键长从0.75 开始，按照0.05 step，计算20个点。SCF通过Read获取初始猜测轨道。
{{{ 
#! h2o.sh
B3lyp/3-21G Scan Guess=read

Geometry
O
H  1   R1
H. 1   R1  2  A1

A1 = 109.0

R1 0.75 0.05 20
End geometry
}}}

== 第四输入块 ==
End geometry行后的所有行为第四个部分，与BDF的传统输入格式相同，用于精确控制各BDF计算模块的参数。这些参数将被加入BDF输入中，具有最高的控制优先级。